پیشگویی تغییرات کنفورماسیونی پروتئین hbsag در بیماران ایرانی مبتلا به عفونت نهفته هپاتیت b به کمک ابزارهای بیوانفورماتیکی

نویسندگان

صفیه صوفیان

چکیده

عفونت نهفته بیماری هپاتیت b به عنوان عفونت با dna hbv قابل شناسایی و آنتی‏ژن سطحی hbsag غیرقابل شناسایی در خون بیماران است. عقیده بر این است که شناسایی ویروس هپاتیت b به وسیله میزبان در منطقه a از آنتی ژن سطحی (hbsag) انجام می‏شود. اما به دلیل فقدان ساختار سه بعدی hbsag، مدرکی برای این فرضیه وجود ندارد. پیشگویی ساختار سه بعدی توالی موتان یافته و وحشی از توالی اولیه، تغییرات ساختاری را آشکار می‏کند. این مطالعه به منظور بررسی تغییرات ساختاری hbsag در حالت نهفته و وحشی در نمونه‏های ایرانی است. توالی hbsag در بیماران ایرانی مبتلا به عفونت نهفته و بارز از بانک ژن استخراج شد. پیشگویی ساختار 3 بعدی با استفاده از مدلسازی از نو و متد l-tasser انجام شد. سپس با استفاده از spdbv مشاهده شد. ممان دوقطبی توسط نرم افزار chimera انجام شد. هر دو توالی وحشی و موتان برای پیشگویی مناطق آنتی‏ژنیک در نرم‏افزار clc main workbenech بررسی شد. نتایج نشان داد که موتان در حالت نهفته باعث تغییر درخواص ساختاری آن می‏شود. این تغییر در شاخص آنتی‏ژنیک و ممان دوقطبی ساختار سه بعدی پیشگویی‏شده نشان داده شده است. یافته‏های این مطالعه تأکید می‏کند که علاوه بر موتاسیون در منطقه a، موتاسیون‏های دیگری هم می‏توانند باعث تغییر ساختاری hbsag شوند. پس در شناسایی و طراحی واکسن باید به ساختار سه بعدی hbsag توجه کرد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

پیشگویی تغییرات کنفورماسیونی پروتئین HBsAg در بیماران ایرانی مبتلا به عفونت نهفته هپاتیت B به کمک ابزارهای بیوانفورماتیکی

عفونت نهفته بیماری هپاتیت B به عنوان عفونت با DNA HBV قابل شناسایی و آنتی‏ژن سطحی HbsAg غیرقابل شناسایی در خون بیماران است. عقیده بر این است که شناسایی ویروس هپاتیت B به وسیله میزبان در منطقه a از آنتی ژن سطحی (HBSAg) انجام می‏شود. اما به دلیل فقدان ساختار سه بعدی HBsAg، مدرکی برای این فرضیه وجود ندارد. پیشگویی ساختار سه بعدی توالی موتان یافته و وحشی از توالی اولیه، تغییرات ساختاری را آشکار می‏...

متن کامل

بررسی سطح سرمی اینترلوکین 12 در بیماران مبتلا به عفونت نهفته هپاتیت B (گزارش کوتاه)

Background and purpose:Occult hepatitis B infection (OBI) is a form of hepatitis in which despite the absence of detectable HBsAg, HBV-DNA is present in peripheral blood of patients. Investigators believed that the genetics and immunological parameters may be different in resistant individuals and patients. Cytokines, such as IL-12, could be leading to alteration in viral immune response. The...

متن کامل

خصوصیات ویرولوژیک بیماران مبتلا به عفونت مزمن هپاتیت B

 Background used to determine prognosis of hepatitis B. The present study was conducted to determine the virologic characteristics of chronic hepatitis B in a group of Iranian patients .  Materials and methods were selected. They had positive HBsAg for at least 6 months. Complementary laboratory tests were achieved as follow: liver function tests, HBeAg, HBeAb , HBcAb and HBsAb. Liver biopsy wa...

متن کامل

بررسی سطح سرمی اینترلوکین ۱۲ در بیماران مبتلا به عفونت نهفته هپاتیت b (گزارش کوتاه)

سابقه و هدف: عفونت نهفته هپاتیت b یک فرم بالینی از بیماری هپاتیت b می باشد که فرد قادر به پاکسازی کامل ویروس از بدن نمی باشد. محققین علت این امر را در تفاوتهای ژنتیکی و ایمونولوژیکی می دانند. سایتوکاینهایی مانند اینترلوکین 12 توانایی ایجاد تغییر در پاسخ ایمنی علیه را ویروس دارند. هدف ما در این مطالعه بررسی سطح سرمی اینترلوکین 12 در بیماران مبتلا به عفونت نهفته هپاتیت b بوده است.مواد و روش ها: د...

متن کامل

تغییرات نوکلئوتیدی توالی ژن کدکننده پروتئین چند عملکردی X در فرد مبتلا به ویروس هپاتیت B

زمینه و هدف : عفونت مزمن با ویروس هپاتیت B (HBV) یکی از عوامل اصلی در ایجاد سیروز و سرطان سلول کبدی است. بیماری‌زایی ویروس به‌وسیله پروتئین چندعملکردی x (HBx) صورت می‌گیرد. تغییر در توالی ژن کدکننده این پروتئین باعث تنظیم فاکتورهای نسخه‌برداری و بیماری‌زایی می‌شود. این مطالعه به منظور آنالیز ژنتیک تکاملی ژن کدکننده HBx در فرد مبتلا به HBV مزمن انجام شد. روش بررسی : در این مطالعه توصیفی آزمایشگا...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
فصلنامه علمی- پژوهشی زیست شناسی جانوری تجربی

ناشر: دانشگاه پیام نور

ISSN

دوره 1

شماره 2 2012

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023